2001년도

- 한국생명공학연구원과의 협약체결 : 동물질병 방어를 위한 형질전환 식물 개발 (2001.7.1.~2002.6.30.) ( 장용석 )

- 한국생명공학연구원과의 협약체결 : 형질전환 식물을 이용한 가축 및 인체 질병용 경구백신 개발 (2001.7.1.~2002.6.30.)( 장용석 )

- 원광대학교와의 과제수행 : 옻칠 산업 인프라 기술과 옻나무 추출물을 이용한 기능성 건강식품 개발 ( 권태호 ) (2001.7.1.~2002.6.30.)

- 한국보건산업진흥원과의 과제 수행 : 한국인 임산부 , 수유부 및 신생아의 지질 및 카르니틴 대사 ( 차연수 ) (2001.6.1.~2002.4.30.)

- 한국보건산업진흥원과의 과제 수행 : Epstein-Barr 바이러스에 대한 백신 연구 ( 장용석 ) (2001.05.01.~2002.04.30.)

- 한국과학기술평가원과의 과제 수행 : 외래 유전자 도입에 의한 식물 단백질의 품질 향상 ( 양문식 ) (2001.9.1.~2002.8.31.)

- 한국과학재단 : Cytokine 은행 ( 장용석 ) (2001.9.1.~2002.8.31.)

- 한국학술진흥재단 : 백신기술연구인력양성사업팀 ( 장용석 )((2001.9.1.~2002.8.31.)

2002년도

- 한국과학기술기획평가원 : 무세포 발현 시스템을 이용한 의료용 단백질 생산 ( 양문식 )(2002.02.01.~2003.01.31.)

- 한국과학기술기획평가원 : 형질전환 식물체의 세포배양을 이용한 고기능 의료용 단백질의 대량생산 및 정제기술의 개발 ( 양문식 ) (2002.09.01.~2003.06.30.)

- 한국과학기술기획평가원 : 전라북도 과학기술혁신체제 구축 및 실행계획 수립 ( 양문식 ) (2002.11.26.~2003.11.25.)

- 한국과학재단 : 전체 정보 및 프로테옴을 이용한 사상성 진균 Aspergillus 의 유전자 발현 시스템의 개발 (2002-10-01 ~ 2003-06-01) 채건상

2003년도

-동물질병 방어를 위한 형질전환 식물 개발 ( 세부 ). 03. 8-04. 3. 과학기술부 프론티어사업 ( 자생식물이용기술개발사업 ).  (3 명 ). 총괄책임자

-형질전환 식물체를 이용한 Dengue 바이러스 백신기술 연구 . 03. 7-04. 6. 과학기술부 과학기술국제화사업 .  (2 명 ). 연구책임자

-경구 점막면역계 자극에서의 면역반응 양상 분석 . 03. 8-04. 7. 학술진흥재단 순수기초연구그룹 (4 명 ). 총괄책임자

2004년도

-돼지 흉막 폐렴 방어를 위한 형질전환체 개발 ( 협동 ). 신기법을 이용한 돼지 흉막 폐렴 예방 백신 개발 ( 총괄 ). 04. 1-04. 12. 농림부 바이오그린 21 사업 . (2 명 ). 협동연구책임자 ( ).

-동물질병 방어를 위한 형질전환 식물 개발 ( 세부 ). 04. 4-05. 3. 과학기술부 프론티어사업 ( 자생식물이용기술개발사업 ).  총괄책임자

-형질전환 식물체를 이용한 Dengue 바이러스 백신기술 연구 . 04. 7-05. 6. 과학기술부 과학기술국제화사업 .  (2 명 ). 연구책임자

-경구 점막면역계 자극에서의 면역반응 양상 분석 . 04. 8-05. 7. 학술진흥재단 순수기초연구그룹 .  (4 명 ). 총괄책임자

2005 년도

-돼지 흉막 폐렴 방어를 위한 형질전환체 개발 ( 협동 ). 신기법을 이용한 돼지 흉막 폐렴 예방 백신 개발 ( 총괄 ). 05. 1-05. 12. 농림부 바이오그린 21 사업 .  (2 명 ). 협동연구책임자